La celiaquía es un trastorno autoinmune en el que la ingestión de gluten daña el intestino delgado. El SII es un trastorno funcional que causa dolor y malestar. Los síntomas del SII pueden aparecer y desaparecer, pero los síntomas de la celiaquía y el daño intestinal ocurren cada vez que la persona ingiere gluten. Las dos afecciones son muy diferentes, pero tienen síntomas similares que se agravan después de comer ciertos tipos de alimentos.
Los síntomas de la celiaquía varían, pero pueden incluir calambres de estómago, hinchazón, diarrea, estreñimiento, náuseas o fatiga crónica, así como síntomas psicológicos como ansiedad y depresión. Los síntomas comunes del SII también incluyen calambres estomacales, hinchazón, diarrea y estreñimiento. Las personas con SII tienden a tener episodios alrededor de seis veces al año o más. Si estos brotes duran unos días o semanas depende de la persona y pueden ser diferentes de un episodio a otro.