Gluten buğday, arpa, spelt, çavdar, kamut ve tritikale gibi tahıl türlerinde bulunan bir proteindir. Bu spesifik genetik yatkınlığa sahip çocuklarda ve yetişkinlerde, gluten içeren veya eser miktarda gluten bulunan gıdaların tüketilmesi, müteakip kronik inflamasyonun ve villusun (atrofi) azalmasıyla birlikte bağırsakta bağışıklık reaksiyonuna yol açar . Çölyak hastalığı ile çeşitli semptomlar ortaya çıkabilir. İnce bağırsak mukozası, yüzey genişlemesi ve besin emilimi görevi gören villus ve mikrovillus ile kaplıdır. Çölyak hastalığı bulunan kişilerde ince bağırsakta yer alan villus ve mikrovilluslar neredeyse hiç azalmaz, böylece ince bağırsak mukozasına zarar verirler. Mukoza zarının düzleşmesiyle daha az besin maddesi (protein, yağlar, karbonhidratlar, vitaminler ve mineral tuzları) emilebilir veya hiç bir besin maddesi emilmez.Sonuçlar beslenme yetersizliği ve eksikliği belirtileridir. Çölyak hastalığı veya daha ziyade gluten intoleransı dünya çapında en yaygın intoleranslardan biridir. Nüfusun büyük bir kısmının Avrupa'dan geldiği ülkelerde (Avrupa, Kuzey ve Güney Amerika, Avustralya) her 100 kişiden birinin çölyak hastası olduğu tahmin edilmektedir. Benzer bir yüzde, nüfusun çoğunlukla tahıllarla beslendiği Kuzey Afrika, Orta Doğu ve Hindistan'da yer alan gelişmekte olan ülkeler için de geçerlidir.