Le prix d'un produit dépend de l'offre et de la demande. Le marché des produits exempts de gluten est petit, par rapport aux produits céréaliers "normaux" contenant du gluten, qui sont fabriqués pour la population en général. Cependant, le prix supérieur de ces produits est principalement dû à la manière complexe de les produire. En 2008, la Commission du Codex Alimentarius a fixé une nouvelle valeur limite pour les aliments sans gluten. Ces produits peuvent contenir au maximum 20 ppm (20 mg/kg, ppm = parties par million). Ces valeurs limites légales de gluten exigent un contrôle extrêmement strict, et des mesures de précaution particulières pour la livraison, la production et l'emballage des aliments. Cependant, seuls des systèmes d'assurance qualité aussi stricts garantissent une grande sécurité des produits. Les matières premières et les produits manufacturés sont soumis à un contrôle permanent, et sont examinés quant à leur teneur en gluten et autres allergènes. La production d'aliments sans gluten de haute qualité et fiables est entièrement automatisée, et utilise les technologies les plus modernes.
En outre, le riz ainsi que le maïs, des matières premières qui sont principalement utilisées dans les aliments sans gluten au lieu du blé, sont plus chers que le blé.