Obiectivul este de a le permite pacienților să se elibereze de „povara” dietei fără gluten. În acest sens, sunt realizate studii, de exemplu, asupra unor soiuri de cereale mai puțin toxice, asupra enzimelor capabile să metabolizeze componentele proteice cel mai greu de digerat pentru persoanele cu boală celiacă, precum și asupra medicamentelor anti-transglutaminază, anti-citokine sau imunomodulatoare, capabile să blocheze răspunsul anormal la gluten (într-un mod similar unui vaccin). În prezent, testele privind eficacitatea acestor potențiale tratamente alternative se află încă într-un stadiu foarte incipient. Printre altele, progresul cercetării de la laborator către studiile clinice este încetinit de lipsa unui model animal pentru boala celiacă. Deși este ușor de imaginat un viitor mai favorabil pentru persoanele cu boală celiacă, este dificil de estimat un interval de timp pentru finalizarea acestor cercetări.
Trebuie subliniat că orice tratament nou va trebui să demonstreze că este superior celui existent, și anume dietei fără gluten, care este sigură, eficientă și ușor de urmat.