Un vaccin pentru boala celiacă ar trebui să funcționeze, în mod necesar, diferit față de vaccinul pentru Covid-19 sau pentru rujeolă. Acestea sunt cunoscute sub denumirea de vaccinuri preventive, care generează un răspuns imunitar nou în organism. Odată ce o persoană a primit un vaccin preventiv sau profilactic, sistemul ei imunitar știe cum să genereze un răspuns de protecție atunci când întâlnește din nou antigenul respectiv.
Un vaccin pentru boala celiacă ar fi un vaccin terapeutic, care vizează un răspuns imunitar deja existent. În cazul bolii celiace, vaccinul ar trebui să reprogrameze sistemul imunitar, pentru a-l învăța să nu mai reacționeze la prezența glutenului.