Bár a tudósok aktívan keresik a cöliákia alternatív kezelési módjait, a mai napig az egyetlen rendelkezésre álló kezelési lehetőség továbbra is az egész életen át tartó gluténmentes diéta. A szigorúan betartott gluténmentes étrend enyhíti a tüneteket, és lehetővé teszi a bélnyálkahártya regenerálódását. Ezért a cöliákia diagnosztizálása esetén a kezelést gyakran „étrendváltásnak” nevezik, amely lehetővé teszi a beteg számára, hogy normális, tünetmentes életet éljen.